《魔术快斗》围绕高中生黑羽快斗展开。快斗发现父亲黑羽盗一留下的密室，得知父亲便是怪盗基德，且父亲并非意外身亡，而是被神秘组织暗杀。为探寻真相、找出杀害父亲的凶手，快斗决定继承怪盗基德的身份。他凭借精湛的魔术技巧，一次次在警方眼皮底下完成华丽的盗窃与逃脱。中森青子是快斗的青梅竹马，她的父亲中森银三是负责追捕怪盗基德的警官。青子不知快斗就是基德，常因父亲追捕基德的辛苦而埋怨基德。快斗在与神秘组织周旋的同时，还要应对警方追捕以及各种企图利用他的势力，在一次次惊险刺激的冒险中守护着秘密，不断接近真相。