《三国机密之潜龙在渊》以汉室危机为背景展开故事。汉献帝刘协驾崩后，为延续汉室、复兴朝纲，其孪生弟弟刘平被秘密从温县召回，替代刘协成为新的傀儡皇帝。刘平在皇后伏寿和满宠、杨修等大臣的帮助下，周旋于曹操、郭嘉等权臣之间。他心怀天下，试图在曹操的掌控下为汉室争取一线生机。伏寿聪慧果敢，与刘平相互扶持，二人在困境中渐生情愫。然而，局势复杂多变，各方势力明争暗斗。曹操势力强大，对汉室虎视眈眈；袁绍等诸侯也蠢蠢欲动。刘平在这波谲云诡的局势中，不断成长，努力平衡各方关系，为了心中的理想和汉室的未来而不懈抗争。