《伽利略特别篇》围绕物理学家汤川学展开。故事中，警方遇到了棘手的案件，嫌疑人有着完美的不在场证明，案件陷入僵局。此时，草薙警官想到了好友汤川学，便向他求助。汤川学凭借其卓越的物理知识和敏锐的洞察力，开始对案件进行调查。他不放过任何一个细节，从看似平常的现象中寻找隐藏的物理原理。在调查过程中，汤川学发现案件背后隐藏着复杂的人际关系和情感纠葛。随着真相逐渐浮出水面，原来这起案件是嫌疑人精心策划的一场骗局，利用物理知识制造了不在场证明。最终，汤川学凭借智慧解开谜团，让真相大白于天下，展现了科学推理的强大力量。