《缩小人特攻队》中，科学家卢瑟将自己和助手黛比缩小至蚂蚁大小，却意外被宠物猫吞进肚子，还被丢到了野外。另一边，卢瑟的女儿克莱尔和儿子瑞克，为了寻找失踪的父亲，也被缩小。他们在微观世界开启冒险，结识了蚂蚁、甲虫等朋友。在这个过程中，他们不仅要应对各种危险，像蜘蛛的攻击、雨水形成的洪水等，还要想办法恢复正常大小回到人类世界。最终，一家人凭借智慧和勇气，克服重重困难，成功恢复原状，也让家庭关系更加紧密。