《黑太阳731之死亡列车》延续了前作对侵华日军731部队暴行的揭露。影片中，731部队为了将细菌武器运往各地实施罪恶计划，利用列车作为运输工具。列车上满载着被当作实验品的无辜百姓，他们遭受着非人的折磨。731部队的军医们在列车上进行着残忍的细菌实验，全然不顾这些人的死活。主人公们在得知这一情况后，决定展开营救行动。他们冒着生命危险，深入列车内部，与日军展开了激烈的战斗。在这个过程中，他们目睹了日军令人发指的暴行，也更加坚定了反抗的决心。最终，他们能否成功解救列车上的百姓，阻止细菌武器的扩散，影片给出了紧张而又震撼的答案，让观众深刻感受到那段历史的残酷与沉重。