在哥谭市的黑暗街头，蝙蝠侠正为打击犯罪而不懈努力。与此同时，下水道中生活着四只拥有超能力的忍者神龟——达芬奇、拉斐尔、米开朗基罗和多纳泰罗，他们也在守护着纽约的和平。一次意外，忍者神龟来到了哥谭市，蝙蝠侠误将他们当作新的犯罪威胁。双方迅速展开了激烈的冲突，蝙蝠侠凭借高科技装备和精湛的格斗技巧，忍者神龟则依靠自身的忍者武艺和默契配合，一时间难分胜负。随着战斗的进行，他们逐渐发现背后隐藏着一个更大的阴谋，邪恶势力企图利用他们的冲突来达到不可告人的目的。于是，蝙蝠侠和忍者神龟放下成见，携手对抗共同的敌人，在一场惊心动魄的大战中拯救了两座城市。